西安交大医学人才培养工作历经105年暨抗战迁陕80年的传承、建设和发展，已经形成了多专业、多层次协调发展的医学教育人才培养体系，为我国西北地区及全国培养了众多医药卫生高级专门人才，教育教学与探得了一系列丰硕，在我国高等医学教育史上留下了浓墨重彩的一笔，为我国医学教育做出了重要贡献。由最初单一的医疗专业发展到现在的包括临床医学、口腔医学、预防医学、学、基础医学、护理学、药学、制药工程、临床药学及留学生学历教育在内的9个专业，涵盖博士、硕士、本科各个培养层次完备的人才培养体系。医学留学生学历教育自1995年开办以来已累计招生2000余名，成为全国首家采用全英文教学的高等医学院校，为中国医科留学生学历教育事业做出了重要贡献。
1958年11月，原西安医学院以“理论联系实际、基础与临床结合”为原则，课程教学全面实行“分科循环、集中教学”模式，成为我国最早的整合课程方案，实现了基础与临床深度融合，了“人体系统”教学新模式。1986 年，学校在陕南三地市举办三年制医学大专班，为基层培养“留得住、用得上”的医生，在课程设置、教学方法、社区建设和社区医学实践等方面取得了可喜成绩。特别是在教学中尝试以问题为导向的教学模式（Problem based Learning, 简称PBL），成为国内最早探索PBL教学的院校。
为培养创新人才，2007年，学校创办了以我国生理学奠基人、著名医学教育家侯濂先生命名的“侯濂医学实验班”，实行长学制医学教育，以全新的教育模式致力于培养医学精英人才，力求打造“掌握系统专业知识，具有良好诊疗技能、国际化视野、人文情怀的高素质临床医师”。实验班医学教育阶段全程采用了“器官—系统”整合课程模式组织教学，借鉴阳明大学新课程的成功经验，依托医学强有力的学科优势，将传统以学科为核心的课程体系按照人体器官系统为线索进行有机整合，构建了以“正常异常—干预—预防”为主线，以“区段”课程为特色的“双循环—回旋式”“器官—系统”整合课程新体系；课程教学过程全程引入了PBL教，把学生的职业价值、态度、医学科学基本知识、沟通技巧、临床技能、群体健康与预防、信息管理、性思维等多个方面的能力培养，融合在整个课程设置和培养过程中，培养学生自主学习、终身学习的习惯以及良好的交流与沟通和合作学习的。整合课程受到了国内医学院校的普遍关注。2015年西安交大与人民卫生出版社、国家医学考试中心共同发起成立“中国医学整合课程联盟”；2016年，西安交大与人民卫生出版社携手打造的中国首套“器官系统”整合课程规划教材正式出版发行。
1984年，学校通过对生理学、病理生理学、药理学三学科实验教学内容的优化、融合、重组，形成了一门的综合性实践课——机能实验学课程，内容包括基本机能实验技能训练、经典机能实验、机能综合实验，以提升学生动手操作能力、解决实际问题能力、科学思维能力和创新能力。经过20余年的实践与探索，“机能学科实验教学体系的研究与实践”获得国家级教学二等，基础医学实验教学中心（含机能学）被评为“陕西省基础医学实验教学示范中心”。
1988年4月，学校成为首批被国家教委批准试办七年制高等医学教育的15所院校之一。长学制医学人才培养工作逐步形成了特色培养模式与培养体系，七年一贯，单开轨道；鼓励竞争，实行了五年制、七年制分流；全方位多渠道加强思想教育。“七年制高等医学教育模式的探索与实施”获得陕西省教学特等，并于1997年获得国家教学二等。1993年以来，学校组织实施“西北地区继续医学教育”项目，开展社区医学教育，得到了美国中华医学基金会的项目支持。1997年，“西北地区继续医学教育方法和途径的探索和实践”获得国家教学一等。学科经过10余年的不断探索，创新学人才的培养模式，以培养学生的创新思维为出发点，优化知识结构，教学内容，解决了多学科交叉渗透、理论与实践相脱节的问题；注重实践教学，构建学理论、技术和司法实践有机结合的教学体系，创建一流的教学，培养应用型创新人才。“创建中国特色学教学新体系，培养国家亟需专门人才”获得国家级教学二等。医学部注重培育高水平教学团队，加强青年教师教学基本功、教学方法培训，为人才培养提供保障。基础医学院生理学课程2004年被评为国家级精品课程，2010年生理学教学团队被评为国家级教学团队，2013 年生理学入选国家级精品视频公开课程。药理学课程2005年被评为陕西省精品课程，2010年被评为国家级双语教学示范课程；药理学教学团队2010年被评为国家级教学团队。注重实践实验教学，注重学生创新创业能力培养，在第二届中国“互联网+”大学生创新创业大赛上取得银1项，铜1项，创历史最好成绩。
1995年，学校成为国内首家举办来华留学生学历教育项目的医学院校，培养全程采取全英文授课。“留学生医学本科教育模式的探索与实践”获得陕西省教学一等。2005年，受教育部委托起草《来华留学生医学本科教育（英文授课）质量控制标准暂行》。2013年荣获教育部“来华留学教育示范”。
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